Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GscQ02591 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GscQ02591 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GscQ02591 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GscQ02591 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GscQ02591 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GscQ02591 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GscQ02591 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GscQ02591 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GscQ02591 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GscQ02591 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GscQ02591 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GscQ02591 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GscQ02591 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GscQ02591 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GscQ02591 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GscQ02591 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GscQ02591 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GscQ02591 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GscQ02591 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GscQ02591 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GscQ02591 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GscQ02591 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GscQ02591 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GscQ02591 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GscQ02591 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GscQ02591 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GscQ02591 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GscQ02591 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GscQ02591 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GscQ02591 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GscQ02591 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GscQ02591 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GscQ02591 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GscQ02591 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GscQ02591 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GscQ02591 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GscQ02591 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GscQ02591 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GscQ02591 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GscQ02591 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GscQ02591 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GscQ02591 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GscQ02591 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GscQ02591 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GscQ02591 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GscQ02591 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GscQ02591 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GscQ02591 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GscQ02591 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GscQ02591 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GscQ02591 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GscQ02591 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GscQ02591 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GscQ02591 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GscQ02591 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GscQ02591 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GscQ02591 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GscQ02591 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GscQ02591 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GscQ02591 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GscQ02591 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GscQ02591 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GscQ02591 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GscQ02591 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GscQ02591 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GscQ02591 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GscQ02591 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GscQ02591 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GscQ02591 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GscQ02591 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GscQ02591 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GscQ02591 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GscQ02591 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GscQ02591 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GscQ02591 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GscQ02591 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GscQ02591 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GscQ02591 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GscQ02591 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GscQ02591 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GscQ02591 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GscQ02591 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GscQ02591 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GscQ02591 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GscQ02591 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GscQ02591 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GscQ02591 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GscQ02591 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GscQ02591 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GscQ02591 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GscQ02591 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GscQ02591 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GscQ02591 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GscQ02591 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GscQ02591 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GscQ02591 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GscQ02591 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GscQ02591 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GscQ02591 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms