Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RykQ01887 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RykQ01887 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RykQ01887 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RykQ01887 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RykQ01887 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RykQ01887 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RykQ01887 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RykQ01887 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RykQ01887 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RykQ01887 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RykQ01887 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RykQ01887 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RykQ01887 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RykQ01887 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RykQ01887 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RykQ01887 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RykQ01887 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RykQ01887 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RykQ01887 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RykQ01887 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RykQ01887 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RykQ01887 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RykQ01887 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RykQ01887 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RykQ01887 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RykQ01887 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RykQ01887 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RykQ01887 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RykQ01887 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RykQ01887 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RykQ01887 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RykQ01887 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RykQ01887 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RykQ01887 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RykQ01887 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RykQ01887 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RykQ01887 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RykQ01887 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RykQ01887 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RykQ01887 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RykQ01887 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RykQ01887 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RykQ01887 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RykQ01887 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RykQ01887 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RykQ01887 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RykQ01887 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RykQ01887 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RykQ01887 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RykQ01887 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RykQ01887 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RykQ01887 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RykQ01887 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RykQ01887 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RykQ01887 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RykQ01887 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RykQ01887 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RykQ01887 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RykQ01887 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RykQ01887 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RykQ01887 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RykQ01887 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RykQ01887 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RykQ01887 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RykQ01887 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RykQ01887 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RykQ01887 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RykQ01887 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RykQ01887 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RykQ01887 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RykQ01887 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RykQ01887 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RykQ01887 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RykQ01887 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RykQ01887 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RykQ01887 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RykQ01887 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RykQ01887 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RykQ01887 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RykQ01887 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RykQ01887 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RykQ01887 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RykQ01887 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RykQ01887 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RykQ01887 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RykQ01887 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RykQ01887 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RykQ01887 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RykQ01887 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RykQ01887 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RykQ01887 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RykQ01887 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RykQ01887 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RykQ01887 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RykQ01887 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RykQ01887 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RykQ01887 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RykQ01887 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RykQ01887 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms