Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Top2aQ01320 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2aQ01320 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Top2aQ01320 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Top2aQ01320 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Top2aQ01320 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Top2aQ01320 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Top2aQ01320 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Top2aQ01320 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms