Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde1bQ01065 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pde1bQ01065 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde1bQ01065 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms