Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd80Q00609 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd80Q00609 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd80Q00609 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd80Q00609 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms