Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp6P97868 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rbbp6P97868 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rbbp6P97868 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rbbp6P97868 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbbp6P97868 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbbp6P97868 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms