Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Neo1P97798 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Neo1P97798 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Neo1P97798 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Neo1P97798 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Neo1P97798 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Neo1P97798 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Neo1P97798 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Neo1P97798 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Neo1P97798 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neo1P97798 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neo1P97798 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neo1P97798 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms