Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ppp4cP97470 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp4cP97470 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp4cP97470 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ppp4cP97470 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppp4cP97470 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppp4cP97470 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp4cP97470 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp4cP97470 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppp4cP97470 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppp4cP97470 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppp4cP97470 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppp4cP97470 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppp4cP97470 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms