Protein–RNA interactions for Protein: P83882

Rpl36a, 60S ribosomal protein L36a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36aP83882 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl36aP83882 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36aP83882 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36aP83882 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36aP83882 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36aP83882 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl36aP83882 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl36aP83882 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms