Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Surf6P70279 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf6P70279 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Surf6P70279 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Surf6P70279 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Surf6P70279 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Surf6P70279 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf6P70279 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf6P70279 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf6P70279 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf6P70279 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf6P70279 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms