Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2d3P61079 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms