Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm2P58774 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm2P58774 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tpm2P58774 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms