Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sssca1P56873 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms