Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab4aP56371 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab4aP56371 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4aP56371 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms