Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp1P55194 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp1P55194 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3bp1P55194 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms