Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cux1P53564 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cux1P53564 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Cux1P53564 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Cux1P53564 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cux1P53564 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cux1P53564 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Cux1P53564 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Cux1P53564 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cux1P53564 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Cux1P53564 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cux1P53564 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cux1P53564 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cux1P53564 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cux1P53564 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cux1P53564 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cux1P53564 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cux1P53564 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cux1P53564 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Cux1P53564 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Cux1P53564 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cux1P53564 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cux1P53564 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cux1P53564 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cux1P53564 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cux1P53564 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cux1P53564 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux1P53564 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Cux1P53564 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cux1P53564 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cux1P53564 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cux1P53564 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cux1P53564 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms