Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TspoP50637 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TspoP50637 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TspoP50637 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TspoP50637 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TspoP50637 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TspoP50637 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TspoP50637 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TspoP50637 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TspoP50637 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TspoP50637 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TspoP50637 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TspoP50637 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TspoP50637 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TspoP50637 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TspoP50637 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TspoP50637 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TspoP50637 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TspoP50637 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TspoP50637 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TspoP50637 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TspoP50637 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TspoP50637 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TspoP50637 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TspoP50637 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TspoP50637 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TspoP50637 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TspoP50637 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TspoP50637 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TspoP50637 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TspoP50637 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TspoP50637 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TspoP50637 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TspoP50637 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TspoP50637 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TspoP50637 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TspoP50637 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TspoP50637 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TspoP50637 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TspoP50637 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TspoP50637 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TspoP50637 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TspoP50637 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TspoP50637 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TspoP50637 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TspoP50637 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TspoP50637 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TspoP50637 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TspoP50637 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TspoP50637 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TspoP50637 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TspoP50637 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TspoP50637 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TspoP50637 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TspoP50637 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TspoP50637 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TspoP50637 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TspoP50637 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TspoP50637 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TspoP50637 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TspoP50637 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TspoP50637 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TspoP50637 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TspoP50637 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TspoP50637 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TspoP50637 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TspoP50637 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TspoP50637 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TspoP50637 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TspoP50637 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TspoP50637 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TspoP50637 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TspoP50637 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TspoP50637 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TspoP50637 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TspoP50637 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TspoP50637 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TspoP50637 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TspoP50637 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TspoP50637 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TspoP50637 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TspoP50637 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TspoP50637 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TspoP50637 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TspoP50637 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TspoP50637 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TspoP50637 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TspoP50637 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms