Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnrnpa1P49312 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnrnpa1P49312 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnpa1P49312 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnpa1P49312 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hnrnpa1P49312 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hnrnpa1P49312 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms