Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Abcd1P48410 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Abcd1P48410 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24,89■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Abcd1P48410 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,5 ms