Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Syt1P46096 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Syt1P46096 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Syt1P46096 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Syt1P46096 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Syt1P46096 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Syt1P46096 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Syt1P46096 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Syt1P46096 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Syt1P46096 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,84
Syt1P46096 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Syt1P46096 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Syt1P46096 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Syt1P46096 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Syt1P46096 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms