Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fkbp4P30416 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fkbp4P30416 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fkbp4P30416 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fkbp4P30416 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Fkbp4P30416 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fkbp4P30416 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fkbp4P30416 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms