Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apex1P28352 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apex1P28352 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apex1P28352 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apex1P28352 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apex1P28352 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apex1P28352 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apex1P28352 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apex1P28352 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex1P28352 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex1P28352 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apex1P28352 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apex1P28352 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex1P28352 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex1P28352 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms