Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja4P28235 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja4P28235 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja4P28235 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja4P28235 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja4P28235 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja4P28235 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja4P28235 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja4P28235 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja4P28235 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja4P28235 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja4P28235 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja4P28235 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja4P28235 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms