Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gjc1P28229 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gjc1P28229 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjc1P28229 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms