Protein–RNA interactions for Protein: P27699

Crem, cAMP-responsive element modulator, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CremP27699 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CremP27699 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CremP27699 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CremP27699 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CremP27699 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CremP27699 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CremP27699 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CremP27699 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CremP27699 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CremP27699 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CremP27699 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CremP27699 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CremP27699 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CremP27699 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CremP27699 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CremP27699 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CremP27699 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CremP27699 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CremP27699 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CremP27699 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CremP27699 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CremP27699 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CremP27699 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CremP27699 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CremP27699 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CremP27699 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CremP27699 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CremP27699 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CremP27699 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CremP27699 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CremP27699 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CremP27699 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CremP27699 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CremP27699 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CremP27699 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CremP27699 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CremP27699 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CremP27699 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CremP27699 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CremP27699 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CremP27699 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CremP27699 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CremP27699 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CremP27699 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CremP27699 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CremP27699 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CremP27699 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CremP27699 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CremP27699 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CremP27699 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CremP27699 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CremP27699 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CremP27699 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CremP27699 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CremP27699 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CremP27699 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CremP27699 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CremP27699 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CremP27699 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CremP27699 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CremP27699 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CremP27699 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CremP27699 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CremP27699 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CremP27699 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CremP27699 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CremP27699 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CremP27699 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CremP27699 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CremP27699 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CremP27699 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CremP27699 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CremP27699 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CremP27699 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CremP27699 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CremP27699 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CremP27699 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CremP27699 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CremP27699 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CremP27699 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CremP27699 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CremP27699 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CremP27699 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CremP27699 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CremP27699 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CremP27699 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CremP27699 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CremP27699 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CremP27699 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CremP27699 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CremP27699 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CremP27699 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CremP27699 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CremP27699 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CremP27699 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CremP27699 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CremP27699 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CremP27699 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CremP27699 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CremP27699 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms