Protein–RNA interactions for Protein: P25364

HCM1, Forkhead transcription factor HCM1, yeastyeast

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCM1P25364 YKL147CYKL147C 618 nt7.22□□□□□ -1.25
HCM1P25364 MNN9YPL050C 1188 nt7.22□□□□□ -1.25
HCM1P25364 NAF1YNL124W 1479 nt7.22□□□□□ -1.25
HCM1P25364 CTF3YLR381W 2202 nt7.21□□□□□ -1.25
HCM1P25364 YNL295WYNL295W 1575 nt7.21□□□□□ -1.25
HCM1P25364 NDE2YDL085W 1638 nt7.21□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.21□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YBL081WYBL081W 1107 nt7.21□□□□□ -1.26
HCM1P25364 NAT5YOR253W 531 nt7.21□□□□□ -1.26
HCM1P25364 MET13YGL125W 1803 nt7.2□□□□□ -1.26
HCM1P25364 APM1YPL259C 1428 nt7.2□□□□□ -1.26
HCM1P25364 WSC3YOL105C 1671 nt7.2□□□□□ -1.26
HCM1P25364 PDA1YER178W 1263 nt7.2□□□□□ -1.26
HCM1P25364 AIM41YOR215C 558 nt7.2□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YPL264CYPL264C 1062 nt7.2□□□□□ -1.26
HCM1P25364 HXT9YJL219W 1704 nt7.2□□□□□ -1.26
HCM1P25364 WSC4YHL028W 1818 nt7.2□□□□□ -1.26
HCM1P25364 COX15YER141W 1461 nt7.19□□□□□ -1.26
HCM1P25364 GNP1YDR508C 1992 nt7.19□□□□□ -1.26
HCM1P25364 MRPL35YDR322W 1104 nt7.19□□□□□ -1.26
HCM1P25364 AGX1YFL030W 1158 nt7.19□□□□□ -1.26
HCM1P25364 OPI1YHL020C 1215 nt7.19□□□□□ -1.26
HCM1P25364 SPE4YLR146C 903 nt7.19□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YMR147WYMR147W 672 nt7.19□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YOL046CYOL046C 675 nt7.19□□□□□ -1.26
HCM1P25364 SPS1YDR523C 1473 nt7.18□□□□□ -1.26
HCM1P25364 DST1YGL043W 930 nt7.18□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.18□□□□□ -1.26
HCM1P25364 DSC3YOR223W 879 nt7.18□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YPT10YBR264C 600 nt7.18□□□□□ -1.26
HCM1P25364 CCR4YAL021C 2514 nt7.18□□□□□ -1.26
HCM1P25364 ICE2YIL090W 1476 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 IMG1YCR046C 510 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YPQ2YDR352W 954 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 NAS6YGR232W 687 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 ATP10YLR393W 840 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YNL165WYNL165W 1221 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 SCO2YBR024W 906 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 DPM1YPR183W 804 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 BNA3YJL060W 1335 nt7.17□□□□□ -1.26
HCM1P25364 MRN1YPL184C 1839 nt7.16□□□□□ -1.26
HCM1P25364 IRC7YFR055W 1023 nt7.16□□□□□ -1.26
HCM1P25364 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.16□□□□□ -1.26
HCM1P25364 MRPL36YBR122C 534 nt7.16□□□□□ -1.26
HCM1P25364 GPD2YOL059W 1323 nt7.16□□□□□ -1.26
HCM1P25364 AFG2YLR397C 2343 nt7.16□□□□□ -1.26
HCM1P25364 SGF73YGL066W 1974 nt7.15□□□□□ -1.27
HCM1P25364 DRE2YKR071C 1047 nt7.14□□□□□ -1.27
HCM1P25364 ERR3YMR323W 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
HCM1P25364 ERR1YOR393W 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
HCM1P25364 ERR2YPL281C 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
HCM1P25364 SSC1YJR045C 1965 nt7.13□□□□□ -1.27
HCM1P25364 YJL163CYJL163C 1668 nt7.13□□□□□ -1.27
HCM1P25364 TUB1YML085C 1344 nt7.13□□□□□ -1.27
HCM1P25364 MPC1YGL080W 393 nt7.13□□□□□ -1.27
HCM1P25364 YNL140CYNL140C 570 nt7.13□□□□□ -1.27
HCM1P25364 YPR076WYPR076W 375 nt7.13□□□□□ -1.27
HCM1P25364 SKP1YDR328C 585 nt7.12□□□□□ -1.27
HCM1P25364 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.12□□□□□ -1.27
HCM1P25364 YMR253CYMR253C 1245 nt7.12□□□□□ -1.27
HCM1P25364 PCL10YGL134W 1302 nt7.11□□□□□ -1.27
HCM1P25364 NEM1YHR004C 1341 nt7.11□□□□□ -1.27
HCM1P25364 PPZ2YDR436W 2133 nt7.11□□□□□ -1.27
HCM1P25364 GET2YER083C 858 nt7.11□□□□□ -1.27
HCM1P25364 COX16YJL003W 357 nt7.11□□□□□ -1.27
HCM1P25364 MRPL19YNL185C 477 nt7.11□□□□□ -1.27
HCM1P25364 DIP5YPL265W 1827 nt7.1□□□□□ -1.27
HCM1P25364 YEL023CYEL023C 2049 nt7.1□□□□□ -1.27
HCM1P25364 PMT1YDL095W 2454 nt7.09□□□□□ -1.27
HCM1P25364 EEB1YPL095C 1371 nt7.09□□□□□ -1.27
HCM1P25364 YIL108WYIL108W 2091 nt7.09□□□□□ -1.27
HCM1P25364 BUD31YCR063W 474 nt7.09□□□□□ -1.27
HCM1P25364 SNP1YIL061C 903 nt7.09□□□□□ -1.27
HCM1P25364 YCL049CYCL049C 939 nt7.09□□□□□ -1.27
HCM1P25364 RBS1YDL189W 1374 nt7.08□□□□□ -1.28
HCM1P25364 PPH21YDL134C 1110 nt7.08□□□□□ -1.28
HCM1P25364 MED6YHR058C 888 nt7.08□□□□□ -1.28
HCM1P25364 TDA4YJR116W 840 nt7.08□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YLR036CYLR036C 612 nt7.08□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt7.07□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YNL234WYNL234W 1281 nt7.07□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YPR130CYPR130C 408 nt7.07□□□□□ -1.28
HCM1P25364 ILV6YCL009C 930 nt7.07□□□□□ -1.28
HCM1P25364 AQR1YNL065W 1761 nt7.07□□□□□ -1.28
HCM1P25364 STD1YOR047C 1335 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 INO1YJL153C 1602 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YJL211CYJL211C 444 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 ATO2YNR002C 849 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 NDJ1YOL104C 1059 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YBL112CYBL112C 318 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YOR200WYOR200W 399 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 KTR3YBR205W 1215 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 TGL5YOR081C 2250 nt7.06□□□□□ -1.28
HCM1P25364 INM1YHR046C 888 nt7.05□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YJL213WYJL213W 996 nt7.05□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.05□□□□□ -1.28
HCM1P25364 GET4YOR164C 939 nt7.05□□□□□ -1.28
HCM1P25364 FIT2YOR382W 462 nt7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.5 ms