Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17,43■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17,41■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17,4■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Gata3P23772 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,38■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17,38■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17,37■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Gata3P23772 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17,36■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,36■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17,36■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Gata3P23772 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Gata3P23772 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17,33■□□□□ 0,36
Gata3P23772 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17,33■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17,33■□□□□ 0,36
Gata3P23772 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17,31■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17,3■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17,29■□□□□ 0,36
Gata3P23772 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17,29■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,28■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17,28■□□□□ 0,36
Gata3P23772 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17,28■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17,27■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Gata3P23772 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,35
Gata3P23772 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,26■□□□□ 0,35
Gata3P23772 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Gata3P23772 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Gata3P23772 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17,25■□□□□ 0,35
Gata3P23772 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Gata3P23772 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,25■□□□□ 0,35
Gata3P23772 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Gata3P23772 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,3 ms