Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Gadd45bP22339 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26,2■■□□□ 1,79
Gadd45bP22339 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gadd45bP22339 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26,14■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26,14■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gadd45bP22339 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Gadd45bP22339 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,2 ms