Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DmdP11531 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DmdP11531 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DmdP11531 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DmdP11531 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DmdP11531 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DmdP11531 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DmdP11531 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DmdP11531 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DmdP11531 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DmdP11531 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DmdP11531 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DmdP11531 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DmdP11531 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DmdP11531 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DmdP11531 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DmdP11531 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DmdP11531 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DmdP11531 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DmdP11531 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DmdP11531 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DmdP11531 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DmdP11531 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DmdP11531 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DmdP11531 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DmdP11531 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DmdP11531 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DmdP11531 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DmdP11531 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DmdP11531 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DmdP11531 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DmdP11531 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DmdP11531 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DmdP11531 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DmdP11531 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DmdP11531 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DmdP11531 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DmdP11531 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DmdP11531 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DmdP11531 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DmdP11531 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DmdP11531 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DmdP11531 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DmdP11531 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DmdP11531 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DmdP11531 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DmdP11531 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DmdP11531 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DmdP11531 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DmdP11531 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DmdP11531 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DmdP11531 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DmdP11531 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DmdP11531 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DmdP11531 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DmdP11531 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DmdP11531 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DmdP11531 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DmdP11531 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DmdP11531 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DmdP11531 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DmdP11531 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DmdP11531 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DmdP11531 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DmdP11531 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DmdP11531 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DmdP11531 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DmdP11531 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DmdP11531 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DmdP11531 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DmdP11531 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DmdP11531 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DmdP11531 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DmdP11531 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DmdP11531 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DmdP11531 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DmdP11531 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DmdP11531 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DmdP11531 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DmdP11531 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DmdP11531 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DmdP11531 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DmdP11531 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DmdP11531 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DmdP11531 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DmdP11531 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DmdP11531 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DmdP11531 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DmdP11531 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DmdP11531 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DmdP11531 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DmdP11531 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DmdP11531 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DmdP11531 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DmdP11531 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DmdP11531 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DmdP11531 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DmdP11531 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DmdP11531 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DmdP11531 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms