Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Igsf6P0C6B7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf6P0C6B7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Igsf6P0C6B7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms