Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprqP0C5E4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprqP0C5E4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprqP0C5E4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms