Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifna9P09235 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms