Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa1P09022 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa1P09022 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms