Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spta1P08032 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spta1P08032 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spta1P08032 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Spta1P08032 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spta1P08032 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spta1P08032 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spta1P08032 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spta1P08032 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spta1P08032 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Spta1P08032 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Spta1P08032 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spta1P08032 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spta1P08032 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spta1P08032 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spta1P08032 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms