Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04212 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04212 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04212 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04212 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04212 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04212 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P04212 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P04212 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04212 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04212 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04212 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04212 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04212 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04212 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04212 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04212 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04212 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04212 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P04212 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04212 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04212 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04212 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P04212 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04212 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04212 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P04212 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04212 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P04212 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04212 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04212 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04212 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04212 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04212 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04212 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04212 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04212 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04212 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P04212 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04212 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04212 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04212 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04212 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04212 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04212 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04212 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P04212 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04212 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P04212 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04212 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04212 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04212 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04212 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04212 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04212 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04212 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04212 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P04212 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04212 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04212 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04212 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04212 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04212 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04212 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04212 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04212 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04212 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04212 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04212 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04212 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04212 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04212 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04212 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04212 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04212 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04212 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04212 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04212 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04212 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04212 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04212 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04212 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04212 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04212 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04212 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04212 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04212 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04212 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04212 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04212 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04212 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04212 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04212 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04212 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04212 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04212 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P04212 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04212 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04212 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04212 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms