Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tp53P02340 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tp53P02340 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53P02340 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tp53P02340 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tp53P02340 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tp53P02340 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tp53P02340 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tp53P02340 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tp53P02340 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tp53P02340 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53P02340 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tp53P02340 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tp53P02340 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tp53P02340 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tp53P02340 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tp53P02340 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tp53P02340 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms