Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ComtO88587 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ComtO88587 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ComtO88587 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ComtO88587 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ComtO88587 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ComtO88587 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ComtO88587 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ComtO88587 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ComtO88587 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ComtO88587 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ComtO88587 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ComtO88587 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ComtO88587 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ComtO88587 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ComtO88587 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ComtO88587 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ComtO88587 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ComtO88587 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ComtO88587 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ComtO88587 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ComtO88587 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ComtO88587 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ComtO88587 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ComtO88587 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ComtO88587 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ComtO88587 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ComtO88587 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ComtO88587 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ComtO88587 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ComtO88587 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ComtO88587 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ComtO88587 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ComtO88587 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ComtO88587 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ComtO88587 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ComtO88587 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ComtO88587 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ComtO88587 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ComtO88587 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ComtO88587 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ComtO88587 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ComtO88587 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ComtO88587 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ComtO88587 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ComtO88587 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ComtO88587 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ComtO88587 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ComtO88587 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ComtO88587 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ComtO88587 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ComtO88587 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ComtO88587 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ComtO88587 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ComtO88587 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ComtO88587 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ComtO88587 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ComtO88587 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ComtO88587 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ComtO88587 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ComtO88587 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ComtO88587 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ComtO88587 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ComtO88587 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ComtO88587 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ComtO88587 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ComtO88587 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ComtO88587 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ComtO88587 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ComtO88587 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ComtO88587 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ComtO88587 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ComtO88587 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ComtO88587 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ComtO88587 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ComtO88587 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ComtO88587 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ComtO88587 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ComtO88587 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ComtO88587 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ComtO88587 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ComtO88587 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ComtO88587 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ComtO88587 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ComtO88587 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ComtO88587 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ComtO88587 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ComtO88587 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ComtO88587 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms