Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly86O88188 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly86O88188 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly86O88188 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly86O88188 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly86O88188 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly86O88188 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms