Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Atf5O70191 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Atf5O70191 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atf5O70191 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf5O70191 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf5O70191 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atf5O70191 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atf5O70191 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atf5O70191 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf5O70191 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atf5O70191 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf5O70191 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atf5O70191 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms