Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChkbO55229 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChkbO55229 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChkbO55229 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChkbO55229 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChkbO55229 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChkbO55229 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChkbO55229 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChkbO55229 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChkbO55229 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChkbO55229 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChkbO55229 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms