Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lgals6O54891 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgals6O54891 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms