Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EomesO54839 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EomesO54839 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EomesO54839 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EomesO54839 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EomesO54839 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EomesO54839 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EomesO54839 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EomesO54839 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EomesO54839 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EomesO54839 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EomesO54839 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EomesO54839 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EomesO54839 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EomesO54839 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EomesO54839 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EomesO54839 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EomesO54839 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EomesO54839 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EomesO54839 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EomesO54839 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EomesO54839 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EomesO54839 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EomesO54839 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EomesO54839 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EomesO54839 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EomesO54839 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EomesO54839 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EomesO54839 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EomesO54839 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EomesO54839 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EomesO54839 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EomesO54839 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EomesO54839 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EomesO54839 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EomesO54839 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EomesO54839 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EomesO54839 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EomesO54839 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EomesO54839 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EomesO54839 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EomesO54839 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EomesO54839 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EomesO54839 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EomesO54839 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EomesO54839 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EomesO54839 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EomesO54839 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EomesO54839 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EomesO54839 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EomesO54839 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EomesO54839 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EomesO54839 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EomesO54839 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EomesO54839 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EomesO54839 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EomesO54839 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EomesO54839 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EomesO54839 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EomesO54839 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EomesO54839 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EomesO54839 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EomesO54839 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EomesO54839 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EomesO54839 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EomesO54839 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EomesO54839 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EomesO54839 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EomesO54839 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EomesO54839 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EomesO54839 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EomesO54839 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EomesO54839 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EomesO54839 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EomesO54839 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EomesO54839 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EomesO54839 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EomesO54839 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EomesO54839 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EomesO54839 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EomesO54839 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EomesO54839 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EomesO54839 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EomesO54839 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EomesO54839 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EomesO54839 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EomesO54839 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EomesO54839 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EomesO54839 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EomesO54839 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EomesO54839 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EomesO54839 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EomesO54839 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EomesO54839 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EomesO54839 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EomesO54839 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EomesO54839 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EomesO54839 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EomesO54839 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EomesO54839 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms