Protein–RNA interactions for Protein: O35083

Agpat1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agpat1O35083 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Agpat1O35083 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agpat1O35083 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Agpat1O35083 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Agpat1O35083 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.8 ms