Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Snap23O09044 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Snap23O09044 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Snap23O09044 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snap23O09044 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snap23O09044 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snap23O09044 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snap23O09044 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snap23O09044 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snap23O09044 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Snap23O09044 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snap23O09044 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Snap23O09044 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snap23O09044 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snap23O09044 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms