Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm21962L7N280 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21962L7N280 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21962L7N280 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21962L7N280 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms