Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20830J3KML6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20830J3KML6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms