Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r12G5E8G1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r12G5E8G1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r12G5E8G1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms