Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip2G3XA57 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip2G3XA57 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip2G3XA57 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip2G3XA57 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab11fip2G3XA57 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip2G3XA57 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab11fip2G3XA57 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms