Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
2610008E11RikG3X964 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
2610008E11RikG3X964 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
2610008E11RikG3X964 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
2610008E11RikG3X964 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
2610008E11RikG3X964 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms