Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7945F6QI24 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7945F6QI24 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7945F6QI24 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7945F6QI24 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7945F6QI24 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7945F6QI24 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7945F6QI24 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms